药剂科设有门诊西药房、中药房、盘松楼药房、住院药房、分院药房、制剂室、药库、临床药学等部门。

　　中心药库负责全院药品的采购和供应工作，严把药品质量关，减少库存，加快周转，保证了全院临床用药的及时、高效、优质，同时开展网上购物，减少药品购销的中间环节。

　　各个药房负责全院门诊和住院病人的处方审查、药品配发、全静脉营养液的配制以及用药指南工作。设置用药咨询窗口，随时解决医生及患者用药方面的问题。

　　医院制剂室生产的药品，每一步骤都是严格按照中国医院制剂生产规范的要求，并已取得药品监督管理部门颁发的药品生产批准文号，且是目前市面上没有供应的药品。其中“鼻炎灵喷剂”、“万丝林”、“咽喉合剂”、“烧伤油剂”等产品，获得了“广州市中医中药优秀制剂产品”称号。

　　药剂科下设临床药学研究室，该室配备的主要仪器设备有：荧光免疫偏振仪，高效液相色谱仪，紫外分光光度计等。主要的工作内容为治疗药物监测、药品不良反应监测、药学信息服务，药师深入临床科室参加查房和病例讨论，并对疑难病症的治疗提出药物治疗的方案。

该室配备的主要仪器设备有：荧光免疫偏振仪，高效液相色谱仪，紫外分光光度计等。