北京功能神经外科研究所成立于1998年，由首都医科大学宣武医院与美国Loma Linda大学合作创办，是中国第一家功能神经外科领域的临床治疗和科研机构，其体制规划与业务设计凝聚了医院管理层和丁育基教授的智慧与心血。李勇杰教授作为主要的创建人，集多年神经科学领域的所学和丰富的疾病治疗经验，满怀对功能神经外科领域的极大兴趣和热情，从美国归来，实现他创办世界知名医疗机构的梦想。

       李勇杰教授将世界前沿水平的疾病治疗理论和技术带回中国，创造性地应用到脑病的手术治疗中。从帕金森病开始，他和他的团队不断追踪世界领域的最新动态，提升治疗水平，拓展治疗领域。运动障碍病中心对帕金森病、震颤、肌张力障碍、扭转痉挛、痉挛性斜颈、舞蹈病和抽动症等疾病的治疗成功率达到98％以上，被美国帕金森病基金会授予卓越成就临床中心成为亚洲唯一获此殊荣的临床机构。与神经内科王玉平教授密切合作，癫痫中心借鉴美国和日本同行多年的理念和经验，对顽固性癫痫的治疗与世界水平齐步走。采用神经外科手术的方法，对慢性顽固性疼痛的治疗提供了一种终极选择的手段，使三叉神经痛、舌咽神经痛、癌痛、幻肢痛、截肢痛等患者重返健康生活。针对日益增多的脑瘫患者，采用微创的、高选择性的和多水平的脑脊髓术式，极大地缓解了他们的行走困难，增强了肢体灵活性。还成功地对一些严重的精神病患者实施了外科手术，使他们重返工作和学习岗位。

         研究所成立八年来，共诊治患者15,000余人，手术治疗3,600例，患者不仅来自全国30个省、市、自治区和港澳台，还有来自印尼、马来西亚、美国、日本的远道求医者。这是一支由高素质的医学人才组成的团队。八年的磨砺，已将北京功能神经外科研究所锻造成具有国际影响力的医疗机构。他们崇尚科学、严谨治学、用全部的精力和智力提升治疗和研究水平，已发表科研论文百余篇，竖起了功能神经外科发展的风向标；他们关爱患者，用仁心和仁术为病人的求医之路提供终点站式的服务。 作为国家的博士后流动站和研究生培养基地，李勇杰教授已培养博士后3名，博士研究生9名，硕士研究生9名。庄平博士和胡永生博士现在每年招收硕士研究生数名。