儿科是东莞市人民医院的重点科室。儿科二区位于红楼普济楼二楼，开放床位共48张，包括新生儿重症监护室(NICU) 18张、儿童重症监护室(PICU)6张、普通新生儿病房22张以及隔离病房2张。病房环境、设备国内一流，配备有丰富经验的医护人员42人。已成为东莞市主要的儿科重症监护治疗中心。

NICU是拥有较先进的进口急救设备的科室。有英国SLE5000等进口呼吸机4台，蓝光治疗仪13台，床边监护仪10台，抢救台2台，温箱23台，微量输液泵和输注泵共20台；进口急救检验设备有：血气及电解质分析仪1台，经皮测胆红素仪、微量血糖测定仪、血压监护仪和氧浓度测量仪等。
儿童重症监护室(PICU) 是我科重点发展的部门，已配备大量较先进的急救医疗设备，有呼吸机4台，高频喷射呼吸机 6 台，惠普心电监护仪2台， 输液泵和注射泵12台，降温机1台。

NICU重视科研工作，以科技创新为动力。承担省卫生厅研究课题有二项：“新生儿硬肿症蛋白C和AT-Ⅲ水平的变化”（1995年省卫生厅课题，获96年东莞市科技进步三等奖）；“呼吸机治疗新生儿呼吸衰竭的应用”， 获1999年东莞市科技进步三等奖；“高胆红素血症的外周同步换血疗法”(1996年省卫生厅课题，获2000年东莞市科技进步一等奖)。目前承担二项市科委立项课题正在进行中。