消化内科是北京医院具有很强实力的治疗消化系统疾病的临床科室。承担着高干医疗保健，老年医学研究，北京大学医学部教学任务。开展了现代化治疗疾病的新技术，新方法，并与国际医学界有广泛的交流。
　　消化内科现有在职医师12人，其中主任医师和知名专家2人，副主任医师3人，博士2人，硕士5人，已退休但坚持专家门诊及病房查访4人（均为主任医师）。
　　我们每天均有消化专家门诊，病房有重症监护和抢救设备，严格执行三级查房制度，及时解决病人问题，全体医护人员具有良好的医德医风。消化内科下属有消化内镜室，实验室，胃肠动力室，能及时有效的治疗病人。
　　消化内镜室：具有先进的电子胃镜，电子结肠镜，电子十二指肠镜，超声内镜及各种与之配套的内镜治疗设备。2003配备内镜学最新高科技设备胶囊内镜并应用于临床，开拓了内镜学领域并极大改善了病人内镜检查的舒适性。消化内镜室除承担常规的胃、肠、胆道检查外，主要开展以下治疗项目：
1．胃肠道出血：经内镜喷药、注射、单极电凝、热探头、微波、金属夹止血治疗。对肝硬化食道静脉曲张破裂出血，采用硬化剂或套圈结扎治疗。
2．胃内异物或结石：碎石.钳抓.网蓝取出。
3．贲门失迟缓症：应用气囊扩张治疗。
4．胃肠道息肉：应用电套圈、微波、电凝治疗。
5．肝外胆总管梗阻、胆总管结石：行十二指肠乳头切开、碎石、取石、放置胆管支架、鼻胆引流等。
6．经皮胃镜引导下胃造瘘。
　　消化实验室：配备有酶标仪、扩增仪等。开展了13c呼气试验检测幽门螺杆菌及粪便幽门螺杆菌多肽快速检测，13c呼气试验检测肝储备功能。检测癌性标记物ca242。
　　胃肠动力室：食道24小时酸碱测定，食道压力测定，肛门直肠压力测定等。