北京医院药学部是院长直接领导下的医院药学技术职能部门。本部现有职工94人，其中主任药师5人，副主任药师6人，主管药师28人,药师42人，药士6人，药品会计2人，其他人员4人。现有职工中大学本部以上人员25人，其中硕士6人，在读博士1人，在读硕士4人；大专毕业45人；中专毕业人员21人；其他3人。2000年以来，我部年药品收入均超过3亿元人民币，年调配处方超过170万张。1994年，实施了药品计算机网络化管理。2002年，对门诊中、西药房，中、西药库进行了规范化、标准化改造，门诊药房实行柜台式服务，全面实施“以病人为中心”和全程化药学服务的宗旨。

      2001年,制剂室按GMP标准进行了大规模的技术改造，总面积1200m（净化控制区580m）生产区净化级别为万级，人流、物流通道为10万级。现有正式批文的法定制剂52种，非法定制剂47种，其中普通制剂67种，灭菌制剂32种。现代化的制水中心（包括：反渗透纯水机，列管5效蒸馏水机，纯蒸汽发生器），有效的保证药品生产质量和全院医疗用水。

       实验室是药学部的重要组成部分，其担负任务之一是为我院临床提供全面的药学信息服务和临床用药质量保证，其二具有我院新药研究开发和临床研究基地新药临床试验的重要职能。实验室总面积900m,它下设分析实验室、精密仪器室、质谱室、常规仪器室、化学室、无菌室、微生物实验室、合成室、临床药学室、临床药理室、中药实验室、动物实验室等。经过多年的不断努力和进取，现已逐步走向正轨，并挤身于国内医院药学同行前列。目前实验室按国际标准设计而成，硬件配备已接近发达国家临床实验室水平，拥有Water`s液-质联用仪和CAPLC-质谱联用仪、Trace2000气相色谱仪、2台高效毛细管色谱仪、8台高效液相色谱仪（含二极管、紫外、蒸发光散射、荧光、电化学等检测器）、红外分光光度计、紫外分光光度计、荧光分光光度计、薄层扫描仪、荧光偏振免疫检测仪等多台进口药物分析设备；实验室管理方面，参照GLP、GCP及国家实验室认可要求，完成了各种程序文件、质量手册等的编写工作，建起了一整套较完善的质量保证体系；先进的计算机网络化办公设施创造了高质量、高效率的数据处理、信息传递、文章撰写及资料评价空间。自1998年FSDA批准我院成为新药临床研究基地以来，实验室已完成人体生物等效性试验和药代动力学研究80余项，其中国家一类新药二项，二类新药三项，三类新药六项，在国内外新药研究领域享有良好地信誉；新药研发工作近年来取得了较大的进展，现已获国家新药证书项目四项，获新药临床批件四项，待批生产项目二项，已上报国家新药审评中心正在审理品种二项，正在进行临床前研究的新药项目四项。药品检验工作是实验室的重要任务之一，它不仅包括药品检验还包括食品检验，不仅涉及自制制剂、外购药品还包括部分进口药品的质量把关，既保证了临床用药的质量，又得到了高干保健的好评，也为医院树立了药品质量过硬的信誉。

         面对新世纪的挑战，我们有信心通过我们的努力和对药学事业的高度责任感，为提高药学服务水平和质量，为广大群众的健康做出更大贡献；更希望与国内外同仁携手，推动我国药学事业的发展。 

     拥有Water`s液-质联用仪和CAPLC-质谱联用仪、Trace2000气相色谱仪、2台高效毛细管色谱仪、8台高效液相色谱仪（含二极管、紫外、蒸发光散射、荧光、电化学等检测器）、红外分光光度计、紫外分光光度计、荧光分光光度计、薄层扫描仪、荧光偏振免疫检测仪等多台进口药物分析设备。

     1991年药学部被卫生部批准为临床药学基地。1998年北京医院被卫生部批准为国家新药临床研究基地，药学部负责基地的管理工作并承担I期临床及基地中心实验室的任务。1983年成为北京卫生学校实习基地；1988年被北京医部大学批准为药学教学基地；2002年被山东大学药学院批准为教学基地。 “九五”期间，我部每年国内核心期刊发表论文持续在30篇以上，先后获卫生部部技成果二等奖1项，局级研究成果一等奖3项、二等奖7项、三等奖8项。