苏州大学附属第一医院早在1916年已开展病理检查工作，当时的人员及设备归属于检验科。病理科正式建立于1961年，在1961-2000年期间，病理诊断工作主要由苏州医学院病理教研室教师轮流承担。随着2000年苏州医学院并入苏州大学，病理科逐渐健全组织建制： 2008年现有正式职工16人，诊断医师10人，高级职称3人，中级职称1人，住院医师4人，其中博士学历1人，硕士7人。

该科设取材室、切片室、诊断室、细胞室、免疫组化室、显微照相室、分子实验室、资料室等。目前拥有Leica荧光显微镜、美国ThinPrep液基学涂片制作系统、Olympus BX-50全自动显微照相系统、LOGENE-1医用多媒体彩色病理图文分析系统、Hybrite FISH变性/杂交及样本处理系统、Leica冰冻切片机等仪器设备，为病理组织处理与诊断、病理教学以及科研等提供了优越的条件。

2007年完成常规病理24000余例，术中冷冰冻快速切片4000多例，免疫组化2000余例, 细胞学检查4000余例。在多个系统，尤其是在淋巴造血系统、呼吸系统疾病、软组织肿瘤及职业病等疾病的病理诊断方面积累了丰富经验。科室除了为本院治疗的患者提供准确的病理诊断之外，还接受来自苏南地区的病理切片会诊。2005年获得全国免疫组化质控优秀奖。我院为全国最早将CISH技术成功应用于乳腺癌HER2基因检测的十家单位之一。此外，我科还开展了液基薄层细胞学涂片检查（TCT），进一步提高了宫颈细胞病理学诊断水平，特别是对早期宫颈癌的筛查具有重要的临床意义。