消化内科是温州医学院附属二院重点科室现有19位医师其中主任医师1位副主任医师3位主治医师6位博士生（在读）1位硕士生7位人才梯队较合理

消化科不仅能诊治消化系统的常见病和多发病还特别擅长于疑难少见疾病的诊治该科在消化系危重疾病的救治方面有较高的成功率

内镜下治疗技术是消化科的特色项目近年来先后开展ERCP及相关治疗项目（如：十二指肠镜下乳头切开取石术壶腹球囊扩张取石术鼻胆管引流术胰胆管各种支架置入术等）；食管狭窄扩张治疗及支架置入术；内镜下注射止血金属钛夹等各种止血治疗术；对消化道早期癌的粘膜切除术（EMR）；内镜下胃造瘘术；食管曲张静脉套扎及组织胶注射治疗术等均取到了较好疗效社会及经济效益显著许多技术在浙南地区处于领先水平近2年连续两次举办了浙江省继续教育项目——结肠镜单人操作术学习班扩大了该科在全省的影响

最近消化科购置了胶囊内镜它大大提高了对小肠疾病的诊断水平到目前为止温州地区仅有附二院拥有胶囊内镜浙江省内仅有两家医院拥有该设备此外消化科即将购置超声内镜对消化道早期肿瘤下粘膜切除术）腹腔神经节阻滞术胰腺假性囊肿穿刺引流术等新项目

胃肠动力方面由于和北京协和医院消化科联系合作密切而北京协和医院在该方面属全国领先单位；因此对胃肠动力学的临床研究方面附二院消化科走在温州市的前头目前已开展的项目有：食管测压食管24小时酸监测胃排空胃肠通过时间胃电图肛门直肠压力和感觉测定胆道测压其中有些项目在我省处于领先水平

在科研方面消化科在炎症性肠病的基础和临床方面有较深入的研究已引起国内同行们的关注