肿瘤医院化疗一科成立于1989年12月，目前拥有正式床位116张，层流病房5张。全科共有医生12人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师4人，住院医师4人；护士20人，其中主管护士师1人，护理师2人，护士17人。目前收治的病种主要有淋巴瘤，乳腺癌，消化道肿瘤等；治疗手段以化学药物治疗、生物治疗、内分泌治疗、免疫治疗及靶向治疗为主。同时能够熟练开展B超及CT引导下纵隔、肝内肿瘤穿刺活检术，胸腔、腹腔置管闭式引流术等特殊诊疗技术。本科室治疗特色是严格按照肿瘤诊治规范，根据病人的病期、病理类型、机体的状况，进行个体化治疗。尤其是淋巴瘤诊治水平，位居新疆领先地位。目前本科室拥有国内先进的干细胞移植净化病房——百级层流病房，自1999年率先在新疆开展了自体外周血干细胞移植治疗恶性实体瘤工作以来，截止2005年10月已成功地对22例患者进行了自体外周血干细胞移植治疗，并取到了良好效果。2003年《自体外周血干细胞移植治疗恶性实体瘤临床研究》课题获乌鲁木齐市科学技术局计划项目资助，2005年6月结题后，获新疆维吾尔自治区科技成果（成果登记号：20050012），并同时获得乌鲁木齐市科学技术进步奖三等奖（证书号2004-3-09）。除了自体外周血干细胞移植治疗恶性实体瘤临床研究项目外，同时开展了多种抗癌药物的三期临床研究以及乳腺癌ERα、HER-2/neu表达与预后关系、新疆维吾尔族NHL遗传学分型特点等课题的研究。