北京中医医院消化中心是北京市中西医结合消化重点专科和北京市脾胃病重点学科，也是国家中医药管理局中医消化重点学科建设单位。因其临床疗效卓著而蜚声中外。是中国中西医结合学会消化专业委员会主任委员和中华中医药学会内科脾胃病专业委员会主任委员所在单位。本中心强调继承，重视发展，是全国脾胃病的研究重点单位， 取得了丰硕的研究成果。近10年获部市级成果20余项，发表相关论文100余篇。
　　消化中心门诊、病房、内镜室、实验室一体，病床38张，业务用房总计达1200余平方米。注重临床疗效，突出中医特色。自70年代开始开展了内镜诊断和内镜下治疗， 同时凭借先进设备,采用中医与西医结合、局部与整体结合、内治与外治结合等方法治疗胃食管反流病、功能性消化不良、消化道出血、慢性胃炎、消化性溃疡、溃疡性结肠炎、肠易激综合症、便秘、胃肠癌、胰腺炎、胆石症、胆囊炎、脂肪肝、酒精性肝硬化腹水等积累了丰富经验，形成了独特优势，建立了简、便、廉、验的专科专病专台，全国各地患者纷至沓来。研制的主要专台特色制剂有止血2号、止血3号、苍脂颗粒、健脾温肾丸、健脾和胃丸、健脾舒肝丸、化郁清胃颗粒、健脾消胀颗粒、克糖降脂丸等，由于疗效显著，深受广大患者欢迎。
　　北京中医消化中心是在充分整合北京中医医院消化科与北京市中医研究所资源的基础上组合而成，具有众多全国著名中医、中西医结合消化病专家。既有雄厚的技术力量，又有先进的仪器设备，如英国的碳－13自动呼气检测仪、瑞典的全消化道动力监测系统等，为学科持续发展、疗效的不断提高及名老中医传统治疗消化病的经验和方药的研究插上了腾飞的翅膀。