口腔科有14个专业学组和口腔诊疗中心，包括牙体牙髓病学专业组；牙周病学专业组；口腔黏膜病学专业组；口腔颌面外科学专业组；口腔修复学专业组；口腔正畸学专业组；口腔种植中心；阻鼾器治疗中心；口腔科实验室；口腔技工室；口腔护理专业组；和正在筹备的无痛牙科治疗中心；义齿制作中心、口腔技术培训中心等。拥有50余台综合治疗台，17张病床和近百名医、护、技人员，人员梯队合理。其中教授、主任医师5名，副教授、副主任医师7名，主治医师21名，住院医师12名，主管护师2名，护师和护士28名，主管技师4名，技师和实验人员6名，博士6名，硕士18名。口腔科承担着北京协和医院的口腔疾病防病、治病工作，同时承担中央保健和外宾的口腔医疗保健任务。口腔科临床业务范围较为齐全，一些较为先进的研究成果已经成为临床常规诊断治疗手段：如牙种植技术，一次性根管充填技术，显微外科技术，正颌外科技术，引导骨再生技术，引导组织再生技术，睡眠呼吸暂停综合征的阻鼾器治疗技术，钛合金铸造技术等。
近年来口腔科承担着各类科研课题十余项，取得了一批科研成果，每年在国内外杂志上公开发表科研论文数十篇。口腔科实现了医学影象资料和临床病例的计算机网络化管理。提高了工作质量，完善了医疗和科研资料的保存和整理，有利于提高医疗质量。完善了医护配合的四手操作体系，使医疗、护理工作更加规范化，并使口腔科初、复诊工作制度化，减少了病人的候诊时间，即方便了患者就诊，又提高了工作效率

1986年获电子工业部科技进步二等奖。多次荣获中国医学科学院及北京协和医院科研、医疗成果奖。1989年还荣获医科院先进集体称号、1992年荣获协和医院先进集体称号。