北医三院血液科是医院的重点学科之一，全科共有医护人员及实验技术人员40余人，其中主任医师、教授4名，副主任医师、副教授3名，主治医师4名，住院医师4名，副主任技师1名，主管技师2名，助理研究员2名。血液科目前共有床位53张，其中骨髓移植病房床位3张，无菌层流室床位6张。
　　北医三院血液内科主要收治疾病：各种急、慢性白血病，淋巴瘤，多发性骨髓瘤，贫血，ITP等出血性疾病?各类血液病及其它恶性肿瘤，并可以为患者进行骨髓移植及造血干细胞移植。北医三院血液内科与北京大学病理系联合，依托大学雄厚的技术力量，使淋巴瘤的诊断规范化、国际化。血液科积极与美、英等国专家合作，采用先进的治疗方案和措施，对淋巴瘤患者的骨髓及外周血标本进行IgH及TCR重排的检测，以检测其微小残留病变并指导患者的后期治疗。近两年，用抗生素治疗胃MALT淋巴瘤成为淋巴瘤治疗史上突破性进展。血液科与在MALT淋巴瘤研究方面处于世界领先地位的英国剑桥大学病理系的杜明清教授合作，采用世界先进的技术方法，对血液科MALT型淋巴瘤患者，进行了t(11;18)检测以指导抗生素治疗并取得了初步成果；并与美国纽约Memorial Sloan Kettering肿瘤中心的化疗及放疗医师合作，在MALT型淋巴瘤的治疗方面积累了丰富的经验，在国内处于领先地位。
　　北医三院血液科自1979年即设立了独立的血液病研究室，目前配备有7名专职的实验室研究人员和技术人员，在北京市及全国属实力较强的实验室，可进行骨髓分类及各种血液病的常规检查。同时，血液科开展了CD34+细胞测定、组织配型、干细胞培养、染色体核型分析、免疫分型、白血病、淋巴瘤的细胞遗传学检查等。细胞遗传学检查包括PCR检测bcr/abl、aml1-eto、PML/RARa、t(11,18), PCR检测淋巴瘤、骨髓瘤的TCR、IgH重排等。
　　北医三院血液内科自1989年始开展自体骨髓移植，1991年在国内率先开展了自体外周血造血干细胞移植术。近年来又开展了异基因骨髓移植治疗恶性血液系统疾病，累计到2006年，北医三院血液内科已进行干细胞移植100余例，显著改善了白血病、骨髓瘤及淋巴瘤等疾病的预后。接受治疗的移植患者随访至今。据最新统计：急非淋白血病的5年总体生存率达74.78%，淋巴瘤的5年总体生存率达83.33%，骨髓瘤的疗效也明显好于单纯化疗。由于我院血液科在干细胞移植方面进行得较早、例数较多，积累了丰富的经验，近年来，国内许多医院的相关科室的医生来北医三院血液内科进行观摩学习，相继建立了各自的移植室，并开展了自体干细胞移植技术。

血液科开展了CD34+细胞测定、组织配型、干细胞培养、染色体核型分析、免疫分型、白血病、淋巴瘤的细胞遗传学检查等。细胞遗传学检查包括PCR检测bcr/abl、aml1-eto、PML/RARa、t(11,18), PCR检测淋巴瘤、骨髓瘤的TCR、IgH重排等。

据最新统计：急非淋白血病的5年总体生存率达74.78%，淋巴瘤的5年总体生存率达83.33%，骨髓瘤的疗效也明显好于单纯化疗。由于我院血液科在干细胞移植方面进行得较早、例数较多，积累了丰富的经验，近年来，国内许多医院的相关科室的医生来北医三院血液内科进行观摩学习，相继建立了各自的移植室，并开展了自体干细胞移植技术。