复旦大学附属中山医院的内镜事业始于上世纪60年代时任内科教研室副主任的李宗明教授用旧德国产半曲式胃镜进行了国内第一例胃镜检查到1992年在现任主任姚礼庆教授的努力下内镜中心正式成立并成立了独立的专科发展至今已成为上海市设施最先进年内镜诊疗人数最多开展内镜诊疗种类最全的单位之一现有教授1人副教授3人主治医生1人住院医生4人主要开展的内镜治疗项目有：内镜下胃小肠造口术消化道超声内镜检查染色内镜胃镜下止血和异物取出术电子气管镜检查食管静脉曲张破裂出血的结扎和硬化剂治疗十二指肠镜乳头括约肌切开治疗胆总管结石胆道镜取石消化道狭窄的内支架治疗贲门失弛缓症气囊扩张治疗胃和肠息肉摘除术消化道黏膜下肿瘤的尼龙绳结扎治疗直肠类癌根治术以及急性肠梗阻和急性梗阻性化脓性胆管炎的引流治疗等2005年诊疗人数超过3万人次各种内镜治疗1200例次较2004年增加了45%
     复旦大学内镜诊疗研究中心成立于2001年由复旦大学附属的各家医院的内镜中心联合成立而成常设机构位于中山医院内姚礼庆教授任中心主任每年定时开设国家级继续教育项目（内镜诊疗学习班）培养40～50名学员每年还定时召开各种学术会议一次对推动我国内镜事业的发展起到了积极的作用

复旦大学附属中山医院内镜中心拥有先进的Olympus专业洗镜机6台包括3台上消化道洗镜机2台下消化道洗镜机和1台支气管镜洗镜机是上海唯一一家实现机械化洗镜的机构完全达到了上海市内镜质控中心的要求达到了国际先进的水平 ? 我们专门开设了病人通道和医用通道实现了医患分道；还配备有专门的洗镜室消毒打包室和镜库实现了内镜清洗消毒存放的一条龙避免了2次污染的发生