北京协和医院中医科成立于1956年，曾聘请北京四大名医之一施今墨，著名中医学家任应秋等为顾问。1975年聘请北京四大名医施今墨的入室弟子、著名中医学家祝谌予作为中医科主任。 现任主任梁晓春教授是祝谌予教授的硕士研究生，为博士生导师。先后承担国家自然科学基金、卫生部、国家中医药管理局等课题9项。

　　中医科目前设有中医门诊、针灸门诊、病房。现有医护人员45人,在职教授4名，退休教授3名，有1名仍在临床一线；副教授12名、主治医师9名。中医门诊设有中西医结合治疗糖尿病、肝病、男性病、冠心病高脂血症、乳腺增生等专科门诊。其中中西医结合治疗糖尿病及慢性并发症方面达到国内同行的先进水平。针灸室采用针灸、按摩、激光等方法治疗各种疾病，积累了丰富的临床经验。尤其擅长治疗心脑血管病、颈椎病、腰椎病、头痛、痛经、面瘫、关节炎、胃炎及多种痛证等。

　　联苯双酯治疗肝炎的研究 获1983年卫生部甲级科技成果奖。获1986年国家发明三等奖及布鲁塞尔尤里卡世界发明奖。血液流变学临床研究 获1992年北京协和医院科技成果三等奖。降糖新药金芪降糖片研究 获1993年卫生部科技进步三等奖。补肾活血方对缺血再灌脑损伤小鼠学习记忆功能及海马神经细胞凋亡的影响 获2000年北京协和医院科技成果三等奖。筋脉通治疗糖尿病周围神经病变临床和实验研究 获2003年北京市科技成果三等奖。