该院前身为阜阳市传染病医院，现已发展为二级甲等综合性医院、安徽医科大学和蚌埠医学院教学医院，诊疗技术居全市领先水平，是皖西北地区医疗、预防、教学、研究中心之一，医疗服务范围辐射省内及邻省交界地区。

全院占地面积13.2万平方米，拥有固定资产1.2亿元,在职职工743人，其中高中级专业技术人员310人。设有阜阳市血液净化中心、中西医结合肝病研究所、呼吸病科、肝病科、肾脏病科、骨科、普外科、胸外科、脑外科、泌尿外科、感染病科、普内科、儿科、心血管内科、神经内科、肿瘤科、妇产科、耳鼻喉科、口腔科、眼科、急诊科、手术室、影像中心、功能检查科、系列内窥镜检查治疗中心等临床医技科室42个和健康体检中心一所。其中呼吸内科为安徽省临床医学特色学科，肝病科、肾脏病科为阜阳市临床医学重点学科，骨科、普外科、胸外科为阜阳市临床医学特色学科。

近年来，在以葛阳同志为核心的院领导班子坚强领导下，坚持以病人为中心，以质量为核心，以科技为先导的办院宗旨，正确处理好医院内涵建设与外延发展、基础质量与技术创新、社会效益与经济效益、近期发期与远期发展、业务发展与文化建设的关系，使医院进入奋进腾飞时期。曾先后获部、省、市级科技成果奖26项，发表学术论文2276篇。在人才发展战略上，既有知名度高、学术造诣深的老专家，又有一批业务精通，颇有建树的中青年技术骨干，能够开展多种专科专病治疗和疑难手术。目前，该院已基本形成了人才梯队合理、专业技术精湛、医德医风端正、医疗设备先进、基础设施完善、服务功能齐全、院容院貌日新月异的花园式医院。年门急诊总量达26万余人次，住院病人12000余人次，业务总收入达亿元，社会效益和经济效益逐年提高。尤其是在应对阜阳市突发公共卫生事件救治工作做出了突出的贡献：继2003年成功治愈了占当时全省2/3的6例非典病人之后，2006年初，又成功治愈了颍上县一例重症人禽流感患者，创造了全国首例使用气管插管机械通气成功救治重症人感染高致病性禽流感病例的奇迹；2007年5月，成功救治了32位5.4氨气泄露中毒人员；2008年为夺取全市手足口病(EV71感染)防治工作的阶段性重大胜利再立新功。