重庆市中医院(重庆市中医研究院)药剂科创建于1951年，随着医院规模的扩大，为了适应临床和科研的需要，药剂科规模也逐步扩大。药剂科现有各类人员53名，其中执业药师有5名，高、中、初级药学技术人员有45名，占全科总人数的74%。全科有业务用房4100平方米，设有门诊中药、中西成药配方部、住院中西成药配方部、中药、中西成药库房、饮片炮制加工室、普通制剂室、中药制剂室、针剂室、药检室及临床药学研究室等业务部门，功能齐全，设施配置完善。

药剂科长期以来坚持把维护人民健康、保障人民用药安全有效放在首要地位，严格执行《药品管理法》及相关政策法规。建立健全了药品质量全面管理制度，非常重视对药品采购、供应、质量的管理，充分发挥药事管理委员会的职能，坚持正规渠道进药，严格执行国家物价政策，加强药品检验，杜绝伪劣药品进入医院，为提高医疗质量和病人用药的安全有效提供了有力保证。于1998年被上级职能部门评为“放心药房”。

药剂科中药及中西成药配方部分别备有品质上乘、价格公道的中药饮片500余种和西药、中成药1000余种，能充分保证临床各种特色用药的需要，并能为病人提供365天全天候服务。同时，为方便病人服药，还专门从韩国进口了五台全自动煎药机，日均煎药量为1000付左右，能为病人提供快速、优质的煎药服务。

本科具有独特的中药饮片炮制技术，年加工能力为100吨左右，能充分满足临床对中药饮片的需求。

药剂科除日常配方工作能完全满足临床需要外，还拥有一个技术力量雄厚、生产设备先进的医院制剂室。本制剂室自20世纪60年代以来，一直从事着医院制剂的研制及创新工作，曾一度处于全国领先地位。先后研制出了参麦注射液、济生乌梅片、妇安康口服液、消痔口服液、疱疹合剂等100余个独具特色的专科、专病制剂，深受广大病员的欢迎。目前的制剂室已投入100万元，按GMP要求设计建设的，在2001年度一次性通过重庆市药监局换证验收、是重庆市首批获得《医疗机构制剂许可证》5个专业机构之一。本制剂室还能为病员提供膏、丹、丸、散等特殊加工服务和为社会团体提供预防季节性疾病的袋装中药。