肛肠科于1957年成立，至今已有40多年历史，以前是本院二门诊部，现已搬迁到院部。分为门诊与病房两部分，门诊位于急救中心大楼5楼，病房位于老一门诊楼上，设有病床15张，开放床位27张。医护人员共13名：其中副主任医师1名、主治医师2名、医师3名、护士7名。业务服务于整个渝东地区，辐射到湖北、陕西等省。多年来，为基层医院培养进修生数十名，实习生数百名，成为该基层医院业务骨干，同时还分担着整个渝东地区肛肠患者的健康咨询，成为渝东地区肛肠治疗中心。
    业务技术：（各种手术方法、多种手段治疗肛肠疾病）
    一、枯切疗法治疗混合痔：外剥内扎硬化注射治疗混合疗；结扎注射疗法治疗内痔；激光、电离子、治疗痔。PPH手术（肛痔吻合术）治疗环状混合痔。
    二、开窗旷置疗法、切缝疗法、挂线疗法治疗肛瘘等。
    三、切断栉膜带、扩创术、纵切横缝治疗肛裂等。
    四、引进新设备电脑大肠灌洗仪，进行肠道水疗，对于大肠炎性疾病有很好疗效。适用于习惯性便秘，慢性结肠炎等症。肠道水疗是一种天然的、彻底的、结肠清洗方法，清洗全段结肠，直接有效地排除毒素，在肠道内环境更为清洁的基础上，再进行药物保留灌肠，会使药效达到最佳的治疗目的，完美体现了中医药保留灌肠疗法的精华。
    肛肠科根据病人不同的病情，设计出不同的手术方法来减轻病人的痛苦、缩短治疗时间。治疗内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛裂、肛乳头肥大、肛周脓肿、肛周湿疹、直肠息肉，直肠脱垂，肛门尖锐湿疣、直肠炎、结肠炎等，取得了很好的疗效及社会效益，受到病人的好评，名声远播。