呼吸科组建于1978年5月现有床位37张包括呼吸重症监护室（RICU）床位3张另有肺功能 纤支镜检查室睡眠实验室和呼吸科实验室南京大学医学院第一第二大军医大学硕士研究生点现有工作人员22名医师10名护士12名；其中博士后1名博士4名硕士2名

　　在临床工作中呼吸内科担负着病人的住院诊治门诊急诊和全院有关科室会诊肺功能检查睡眠疾病检查纤维支气管镜检查和支气管照射影像检查院外会诊抢救世等日常工作；以及干部病房的特医下基层的巡回医疗健康查体医院急救医疗队抗洪救灾医疗队等临时工作1978年建科后逐步开展了对各种呼吸病的诊断和治疗在国内较早地开展了经皮肺穿刺活检纤维支气管镜等检查1994年建立睡眠实验室并率先在军内开展睡眠疾病的诊断和治疗并于90年代在国内报告了首例军团菌病并首次分离出一株军团杆菌从而开始在全国有一定的知名度

　　目前科室在临床工作和为病人服务方面的特点有：1各种呼吸道感染性疾病的诊断和治疗如军团菌病肺炎衣原体感染组织胞浆菌感染重症和难治性肺部感染等曾成功救治20多例重症肺部感染病人的生命；2睡眠疾病的诊断和治疗：在睡眠呼吸暂停综合症的诊治方面处于国内领先水平即通常老百姓所说的打鼾症可以对打鼾的程度进行判断作出是否为疾病状态的诊断以及如何进行治疗；3呼吸衰竭与机械通气治疗：呼吸衰竭是呼吸系统疾病的重症该科在呼吸衰竭的救治方面积累了许多经验抢救成功率很高尤其是需要气管插关和人工机械通气的病人此外哮喘的治疗肺癌的化疗等方面在南京市也有一定的知名度