北京世纪坛医院（原北京铁路总医院）临床检验中心是医院下属的综合性医技科室，是医院重点发展专科之一。2002年，首批通过了卫生部临床检验中心进行的行业资格检查，2003年，北京市医院等级评审检查组专家和领导对中心各项工作给予了充分肯定，尤其是对中心的质量管理、业务水平和 服务态度提出表扬。2005年通过北京市临床检验住院医师培养基地的评审，获得了北京市检验住院医师培训资格。

　　中心还具有严格的室内质量控制管理体系，建立了全套室内质量控制方法，并有质量监察小组每月进行督察，确保向临床和患者提供全方位的优质服务。中心的检验质量受控于卫生部及北京市检验中心，各专业实验室已连续十多年被评为优秀质控管理单位。

　　中心自1996年来，承担北京大学医学部预防医学系实验诊断学的教学以及北华大学、大连医学院、东南大学检验系的实习带教任务。

　　中心下属三个二级单位，即检验科、中心实验室和输血科。其中，检验科包括免疫室、生化室、临检室和微生物室四个专业实验室，主要是为临床患者提供临床检验、临床生化、临床免疫和临床微生物学检查；中心实验室属科研型单位，主要承担国家、北京市、铁道部及全院相关科研任务；输血科主要承担全院的临床用血、急诊用血、用血审批等工作及用血相关实验室检查。

检验中心拥有固定资产上千余万元，其中各种先进、高精尖设备数十台，如全自动生化分析仪（日立7600-020+ISE型全自动生化分析仪、日立7080型全自动生化分析仪）；急诊快速全自动干式生化分析仪；全自动化免疫分析仪（Beckman Access微粒子化学发光分析仪、Liaison全自动免疫分析仪、2台AxSYM微粒子荧光免疫分析仪）；此外拥有美国DADE BN100特种蛋白分析仪、Roche血气分析仪、OLYMPAS 荧光显微镜及染色体成像分析系统、自动化酶标仪等大型检验仪器；美国DADE公司微生物鉴定和药敏检测系统，美国BD全自动血培养仪，法国梅里埃公司API鉴定系统，日本SANYO CO2培养箱；其它仪器还有2台PCR扩增仪（包括荧光定量PCR）、双向电泳分析系统、全自动毛细管电泳仪、高速低温离心机和高速冷冻离心机系统、自动凝胶图像分析系统、程序降温仪、紫外透射分析仪、倒置显微镜等；中心还拥有完整的细胞培养所需的百级超净细胞培养室和操作室。

2003年，北京市医院等级评审检查组专家和领导对中心各项工作给予了充分肯定，尤其是对中心的质量管理、业务水平和服务态度提出表扬。2005年通过北京市临床检验住院医师培养基地的评审，获得了北京市检验住院医师培训资格。