口腔正畸科创建于1949年，是我国成立最早的口腔正畸诊室，初期即具有一定规模。1977年经卫生部批准成立口腔正畸科，并确定为口腔医学二级学科。1996年被批准确立为211重点工程学科。口腔医学专家毛燮均教授一手创建了学科，是著名的学科带头人。建立以来，共取得国家级科研成果4项，部市级科研成果21项，局级科研成果9项，在口腔界排名第一。承担科研基金项目23项，其中，国家自然科研基金9项，占据首位。目前30名医师人员中，80％拥有博士学位，60％有一年及以上的海外留学经历。
      口腔正畸科拥有以毛燮均教授、黄金芳教授、傅民魁教授为代表的国内著名、国际知名的学科带头人，在全国口腔正畸学界享有极高学术声誉。 
      在学科的创始阶段：
      毛燮均教授（1901-1979）是我国著名口腔医学家、教育家，是我国口腔正畸学科奠基人，为我国口腔正畸学科的创立发展和人才培养作出了重大贡献。1930年以博士学位毕业于华西协和大学牙医学系，历任北京医学院院务委员会委员，《中华口腔科杂志》总编辑，中华医学会理事，卫生部医学科学委员会委员，口腔专题委员会主任委员，是口腔界仅有的一级教授。半个多世纪前他提出了“口腔医学是一门生物学科”，“口腔医学与其它医学各科及自然科学，社会科学有着重要关系”，在学术思想上取得了重要建树。经他锲而不舍的努力，促使狭隘的牙医学转变为口腔医学，并发展为一门有独立理论、操作基础的科学科目。今天，口腔医学与医学各科，生命科学，信息工程学科的结合使之飞速发展，更体现出毛燮均教授学术思想的精辟。
      黄金芳教授（1922-1997）于1949年毕业于北京医学院，历任北京医学院院务委员会委员、学术委员会委员，中华医学会口腔科学会口腔正畸专业学组第一任组长，中华口腔医学会口腔正畸专业委员会顾问，卫生部高等医药院校口腔专业教材编审委员会委员，《中华口腔医学杂志》等6种期刊编委和特约编委。经她的不懈努力，使口腔正畸学首批成为口腔医学的临床博士点，从口腔矫形学中分离出来建立独立教研室，出版全国统编的口腔学专科教材，任第一版《口腔正畸学》统编教材主编，为口腔正畸今天的蓬勃发展局面奠定了第一块最为坚实的基石，加快了我国口腔正畸学科的发展。

学科研究分为以下几个方面： 
颅颌面的生长发育与X线头影测量研究 
      科室于60年代至90年代进行的X线头影测量系列研究，运用先进计算机图像处理技术确立错?畸形患者形态改变的客观诊断指标，改写了我国本病诊断依赖于传统型口腔颌面部检查的滞后局面，从而大大提高诊断精确度。该研究所建立的中国人X线头影测量标准已成为当今世界各国华裔的通用诊断判定标准，达到国际先进水平。这一研究的系列成果，如“正常?人的X线头影测量研究”、“电子计算机技术在口腔正畸学科的应用”、“人颅面生长发育的X线头影测量研究”、“中国人软组织侧貌及软硬组织结构对比的X线头影测量研究”、“口腔X线头影测量的研究”等等，先后于1978年、1985年、1986年、1989年、1992年、1994年获全国医药科技大会、卫生部、国家教委及北京市科技进步奖，共计7项。科室现成立有生长发育中心，并在进行儿童和青少年的长期生长发育追踪研究。

基础研究
      口腔正畸科附设骨代谢基础等研究组。结合国内外实验室条件，完成对矫正牙齿移动过程中牙槽骨改建的生物学特征等国家级、部市级研究课题。两项成果获美国、日本科技奖。1992年局级科研奖励1项。

口颌系统的功能研究和病生理研究
       口腔正畸科附设的功能等研究组。对口颌系统的肌压力、颞下颌关节、咀嚼肌电及下颌运动轨迹、口腔吞咽功能、?接触点、上气道，以及语音等进行多方面研究。承担国家级、部市级、局级多项研究课题。此方面的系列研究，如“颞下颌关节紊乱综合征的正畸治疗”、“前牙舌倾型深覆?畸形的综合研究”、“正常?与错?畸形的多因素分析研究”、“唇腭裂?颌面形态及口颌系统功能”、“错?畸形与口颌功能”、“口腔矫治器治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的机制研究”，分别于1987年、1989年、1990年、1998年、2001年、2002年获部市级科技奖励5项，局级科技奖励2项。

临床矫治技术的提高
       口腔正畸科主要开展儿童牙颌畸形的矫正治疗，近20年来已完成治疗各类错?畸形病例约30000例，治疗优良率达99％以上。目前每年接受约3000名初诊病人，其中疑难病例占60％，其接诊规模、疑难病例总量及治疗优良率均居国内领先水平。
       诊断研究方面，毛燮均教授推出的毛燮均错?分类法1978年获国家科学大会奖，作为中国研究学者对世界的贡献，编入教科书，至今广为使用。
       治疗研究方面，我国正畸学科的发展大致分三个历史阶段：活动矫治器治疗阶段、固定矫治器治疗阶段和矫治－功能结合矫治阶段。在活动矫治器治疗阶段，“环托式活动矫治器”获得全国科技大会四等奖及北京市科技进步二等奖（1983年），国家发明奖四等奖（1987年）；“前牙反?的早期矫治”获北京市科学技术成果奖三等奖。在当时的条件和背景下，这些矫治器发挥了巨大的作用，部分矫治器目前仍在使用中。八十年代起，科室率先从国外引进世界先进的方丝弓固定矫治技术，使我国正畸专业水平逐渐与国际接轨并达到国际先进水平。1985年，傅民魁教授在《中华口腔科杂志》发表了国内第一篇有关“方丝弓矫治技术的原理和应用”的论文，为我国口腔正畸专业开辟了一个崭新的局面。口腔方丝弓细丝弓矫正技术及其应用研究，于1986年、1990年、1992年获得部市级科技奖励3项。“现代口腔正畸学”于1998年、2000年获卫生部科技成果三等奖和教育部高校自然科学奖。“直丝弓矫治技术在错?畸形治疗中的应用”于1999年获教育部科技进步三等奖。在技术引进同时，结合中国人牙颌畸形特点，进行整体矫正托槽、Begg细丝弓托槽、国产澳丝、中国人直丝弓托槽的开发研制。其中NiTi弓丝成为中国正畸学界首创的发明，得到世界各国正畸同行高度评价。“釉质粘合剂”、“直接粘合口腔正畸附件”分获国家级（1978年）、局级（1990年）科技奖励。结合中国人牙弓数据的直丝弓托槽，获国家专利（1998年）。与此同时，口腔正畸拓展了治疗和研究领域。颞下颌关节紊乱征的治疗、牙－颌－面畸形的手术矫治、阻塞性睡眠综合征的口腔矫治分别于1987年、1998年、2002年获得部市级科技奖励。“阻鼾器”获国家专利（1999年）。牙周炎、唇腭裂的正畸治疗等临床系列，亦取得良好效果。