北医牙周科初建于五十年代初, 当时为具有一定规模的诊室。1984年正式重建牙周科, 承担牙周病学的医疗、教学和科研任务。目前全科人员39名, 其中博士生导师3名, 硕士生导师2名。医师共19人:主任医师5人，副主任医师5人，主治医师8人，住院医师1人，其中具有博士学位者11人，硕士以上学位者6人(共占医师的89.5%), 洁治员4人，护士14人，实验室技术员1人，护工1人。全科有综合治疗台29台, 科室规模在国内属前列。牙周科为中华口腔医学会牙周专委会主任委员单位多年（现任名誉主任委员1人，副主任委员2人，常委1人），全国统编教材“牙周病学”主编单位，还承担国家药监局药物临床研究基地、全国牙防组指定的口腔保健用品检测中心、、亚太地区牙周协会中国理事等任务。
      牙周科开展牙周疾病的防治工作,年治疗来自全国各地的牙周病患者48,000人次, 治疗显效率为94.5%。除严格按规范进行高质量的牙周基础治疗外, 强调多学科的综合治疗(如调 、牙髓治疗、正畸、修复、关节及中医疗法等)和手术治疗相结合, 注重患者的长期随访、口腔卫生指导和监控以及维护治疗，以求得长期而稳定的疗效。八十年代开始的“牙周炎疗效及活动期的监测”、九十年代开展的“引导性牙周组织再生”、膜龈手术、植骨术等具有代表性的重点技术项目为国内领先, 部分已达国际水平，现已开展牙周治疗、维护、种植、修复一体的种植技术，逐渐与国际种植工作的开展方式接轨。
      牙周科对疑难病例具有较高的诊断水平。如Papillon-Lefevre综合征、口-面-指综合征及青春前期牙周炎的确诊均由我科率先在国内报道。对白血病、Crohn’s病、淋巴瘤、组织细胞增多症、低磷酸酶血症、甚至牙龈癌以及牙龈结核等全身疾病在牙周组织的表征、药物性牙龈增生、牙龈出血、浆细胞肉芽肿等疾病和状况都具有较强的诊断能力, 准确率达95%以上。
      牙周科还承担本科生、研究生、大专班、师资班、中专班(口腔护校)、学硕连读班、医疗系、继续教育以及岗位培训班等多层次的牙周病学教学工作。多年来为全国22个省市培养进修医师近200人, 编写教材及参考书10余部。举办国家级继续教育班9次, 编制的教学录相片“牙周病的诊断”于1991年获北京市优秀教学片一等奖。2004年起，以牙周科为主体承担了北京大学口腔医学院和香港大学牙医学院合作办学的任务，在国内口腔医学界首创开办国际化的临床医学研究生班的先例。
      牙周科于1984年开始招收研究生, 已毕业博士生14名，硕士生（包括学硕连读生）20名,并有5名在职人员获得博士学位、5名获硕士学位; 目前在读博士生5名硕士生6名, 博士后1名，另有3名在职人员攻读博士学位，2名在职人员攻读硕士学位。毕业后的研究生均已成为临床和科研的骨干。
      牙周科实验室在临床和基础研究方面也非常具有实力，尤其是临床科研工作更具优势。多年来,已完成国家级及部市级科研项目8项, 目前正在进行8项, 已完成国际合作项目4项，正在实施一项，共获科研基金210万元, 科内自选的临床科研题20项，完成国家下达的药物临床研究10项。在各种期刊发表论文214篇, 其中国际期刊20余篇, 曾获卫生部科技进步奖5项, 北京市优秀论文奖6项。
      1980年以来,积极开展国际、国内学术交流, 先后有15人, 70余次出国访问、进修和开学术会议, 应邀30余次在美国、日本、意大利、韩国、马来西亚、瑞士、英国、荷兰、澳大利亚、加拿大、香港等做学术报告。与国外著名大学有广泛的学术交流，经常邀请知名学者来我科讲学和学术讨论。1996年成功地在我院主办了第5次全国牙周病学术会议暨中日牙周研讨会。1999年举办中日口腔医学大会牙周分会和第六次国际牙周研讨会。
     “保持国内领先地位, 建设国际水平的牙周病学科”是北大口腔医院牙周科全体人员努力的目标，牙周科将继续保持高质量的医疗水平, 积极开展新技术新疗法, 丰富治疗手段, 继续开展多样化的健康教育, 形成自己的防治特色。