马应龙肛肠医院肛肠外科由全国肛肠学会资深专家方承轼担任医学领头人，拥有专业化、高水平的医护团队，其中博士4人，副高职称以上医务人员10余人，中西结合主治医师6人;护理队伍由学历高、水平高、经验丰富、责任心强的优秀护士组成;现有开放病床80张。该科室运用中西医结合方法治疗各种肛肠疾病，如内痔、外痔、混合痔、肛裂、肛门直肠周围脓肿、肛瘘、肛窦炎、肛乳头炎、肛乳头肥大、直肠脱垂、肛门狭窄、大便失禁、肛门皮肤病、肛门出口梗阻性便秘、盆底肌失驰缓综合症、肛管、直肠息肉、溃疡性结肠炎、结肠癌、直肠癌等，为肛肠病患者解除病痛。

马应龙肛肠外科拥有电子结肠镜、高频胃肠X光机、带双面肛管直肠超声探头的彩色B超、全自动水疗机、熏洗机、红外治疗仪、微波治疗仪、高频电刀等一批先进的专科诊疗设备。可开展PPH手术、内痔注射术和“回”字法结扎术等等。对于环状混合痔，采用一次性根治术，疗效好，复发少，无严重并发症;对于复杂肛瘘，采用荣获国家专利技术的“瘘管铣刀”配以“汪氏铣瘘术”来治疗，具有微创无痛一次性治愈的功效，大大缩短了疗程;其肛管复杂性损伤重建术也能有效减轻病人的痛苦。此外，马应龙肛肠医院在治疗肛肠疾病方面拥有马应龙独家研制生产的马应龙麝香痔疮膏、马应龙麝香痔疮栓、痔炎消片、地奥司明片等品牌药，还开设了肛肠理疗室(即熏蒸、坐浴、微波、红外)，特别是马应龙独家研制成的名老中医验方“金玄痔科熏洗散”的运用，具有药到病除、药效直接、取效快捷、使用方便的功效。毫不夸张地说，马应龙肛肠外科的医疗技术水平已进入全国前列。

电子结肠镜、高频胃肠X光机、带双面肛管直肠超声探头的彩色B超、全自动水疗机、熏洗机、红外治疗仪、微波治疗仪、高频电刀等一批先进的专科诊疗设备。