神经内科成立于1961年。建科前为内科神经专业组。神经内科成立时，设病床10张，1964年增至15张。1972年医院恢复后病床增至18张。1993年神经内科病房迁至干部病房一楼，设置床位24张;同年成立神经免疫实验室。2001年病床增至40张。

神经内科建科前后，医疗工作主要进行神经内科常见病的诊断治疗并开展一些疑难病的研究。

1965年后，开展颈内动脉导管血管造影及治疗中风、脑水肿;

1974年后，开展激素及ACTH(促肾上腺皮质激素)加人工呼吸抢救重症肌无力;气管切开、电动呼吸抢救格林-巴利综合征;用大剂量EACA(6-氨基乙酸)治疗蛛网膜下腔出血。用干扰素、转移因子治疗散发性脑炎及格林-巴利综合征。

1983年后，开始用胞二磷胆碱、脑复康静滴治疗中风恢复期，对格林—巴利综合征采取不用激素治疗方案，疗效优于使用激素。

1985年后，开始用钙通道阻断剂治疗脑缺血;用大剂量地塞米松治疗急性脑中风，降低了死亡率。

1990年后开展大剂量甲基强的松龙冲击疗法治疗重型格林—巴利综合征。

1993年在国内率先开展神经学系统副肿瘤综合症的基础与临床研究和抗特异性神经元抗体(抗Hu-抗体，抗Yo-抗体，抗Ri-抗体)的检测项目。

1994年后与ICU协作开展钻颅碎吸治疗急性期高血压性脑出血。

1996年后与介入科协作开展对脑梗塞患者超早期动脉介入溶栓治疗及大剂量免疫球蛋白治疗急性感染性多发性神经炎、重症肌无力、重症多发性肌炎。

1998年起将蛇毒制剂(力源精纯蛇媒)治疗急性期脑梗塞用于临床。开展局部注射Ⅰ型肉毒素治疗痉挛性斜颈、面肌抽搐等锥体外系疾病，开展静脉输液“PGE”所致疼痛及静脉炎的护理研究。

2001年在省内首先开展MTD(热成像仪)检测神经系统项目。在国内首先开展抗特异性神经元抗体(抗Hu-抗体，抗Yo-抗体，抗Ri-抗体)的检测项目。

1959年国内首先报道“农药1059所致神经系统中毒”;1963年国内首例报道“Huntington舞蹈症”;1990年至1992年国内外首先报道钩端螺旋体L型脑炎、钩端螺旋体L型烟雾病、钩端螺旋体L型神经根炎;首先发现神经系统副肿瘤综合征病人尿液中存在抗Hu-抗体等。“抗-Amphlphysin抗体与神经系统副肿瘤综合征的免疫学研究”论文获安徽省第三届自然科学优秀学术论文二等奖;“副肿瘤性感觉神经元病的免疫学研究”获安徽省第三届自然科学优秀论文三等奖。2001年，神经系统副肿瘤综合征的基础与临床研究获安徽省科技进步三等奖。